目的 通过对毛竹( Phyllostachys edulis (Carri.)H.deLehaie) CPD 基因的分子特征和表达模式进行研究分析,为揭示 CPD 在参与毛竹笋生长调控、光诱导以及响应胁迫过程中的作用提供参考依据。 方法 在毛竹基因组数据库(BambooGDB)中查找 CPD 的同源序列,设计引物并克隆 PeCPD 。通过生物信息学的方法分析 PeCPD 的基因结构、顺式调控元件、其编码蛋白的基本理化性质、保守结构域、进化关系以及该基因在不同组织中的表达模式等,利用实时定量PCR方法分析该基因在不同高度笋、昼夜节律光照条件下以及干旱、低温胁迫处理下叶片和根中的表达模式。 结果 获得了毛竹 CPD 同源基因 PeCPD (PH01003419G0030),cDNA全长为1 584 bp,包含5'和3'端非编码区分别为110 bp和64 bp,编码区为1 410 bp,对应的基因组长度为2 796 bp,外显子和内含子数量分别为6个和5个。克隆获得了 PeCPD 编码区,与BambooGDB中PH01003419G0030序列完全一致,编码一个470 aa的蛋白,分子量约为52.2 kDa,理论等电点为9.063。同时获得了 PeCPD 上游序列(1 999 bp),与数据库中序列完全一致,分析发现,其中除了启动子基本元件外,还含有多种与环境相关的作用元件,如参与低温应答的LTR、干旱响应的MBS和光响应元件AE-box、TCT-motif等。基于CPD氨基酸序列的系统进化分析表明,毛竹与水稻、玉米、谷子和二穗短柄草等单子叶植物聚类到一个大的分支,其中与二穗短柄草的亲缘关系最近。基于转录组数据的基因表达热图分析发现, PeCPD 在毛竹7个不同组织中的表达存在明显差异,其中在20 cm笋中的表达量最高,根中表达量最低。实时定量PCR分析表明,随着笋的增高, PeCPD 表达量呈上升趋势;在昼夜节律光照条件下, PeCPD 表达量随着光照时间延长而上升,随着黑暗时间延长而下降;干旱和低温胁迫条件下,叶片和根中 PeCPD 的表达量均呈先上升后下降的趋势。 结论 从毛竹中获取得到了 CPD 同源基因 PeCPD ,该基因为组成型表达,且随着笋的增高其表达量呈上升趋势,可能通过参与BRs的生物合成对竹笋的生长起调控作用; PeCPD 在叶片中的表达呈现昼夜节律变化,表明该基因可能会参与毛竹的光形态建成;干旱和低温胁迫条件下, PeCPD 表达量的变化有助于提高毛竹适应逆境胁迫的能力。